Il comune di Gjilan si trova nella parte sudorientale del Kosovo, nella regione di Anamorava. È uno dei comuni più grandi del paese. La sua posizione geografica consente di avere buoni collegamenti con altri centri del Kosovo e della regione. Attorno alla città di Gjilan sorge la Collina dei Martiri (Popovica), Gllama, Dheu i Bardhe, l'area di Malisheva, Zabeli di Sahit Agas e il Bregu i Thate. Ci sono tre piccoli fiumi, Mirusha, Banja e Stanishori, che si uniscono e si dirigono verso Morava, a ovest del villaggio di Uglar. Gjilan è lontano da Pristina, capitale del Kosovo, 46 km da Kamenica - 27 km, da Vitia - 22 km, da Artana - circa 25 chilometri. I comuni della regione sono delimitati a sud-est con Presevo (33 km) e Kumanovo (53), mentre in est - con Bujanovac (40 km). La costruzione della strada di Gjilan / Gnjilane-Lipjan, dalla direzione di Kishna Polas, ha ridotto notevolmente le distanze di questo comune con l'aeroporto di Pristina, la strada nazionale e le Ferrovie del Kosovo, a Ferizaj e Lipjan. Presto sarà collegato a Kumanovo, dalla direzione di Stançiq, dove è prevista l'apertura di un punto doganale.
Gjilan ha buone condizioni per l'agricoltura ed è conosciuta come una città agro-industriale. Ha un clima medio continentale, con estati calde e inverni freddi. La temperatura media di gennaio è -0,9 gradi Celsius, mentre la temperatura media di luglio - 21,5 gradi. In autunno, la pioggia cade qui, media 177 mm, mentre in estate - 129 mm. La quantità di pioggia in primavera è 145 mm e in inverno - 130 mm.
L'area di Gjilan / Gnjilane è definita dal fiume Morava e Binçës, che raccoglie tutti i piccoli fiumi, con una portata media mensile di 6,7 metri cubi al secondo. Il sud-est è circondato dai monti Karadak.
Le coordinate dell'estensione della città di Gjilan sono 42 gradi a nord e 21,20 gradi est e ad un'altitudine di 501 e 590 m, mentre la regione 475 m di Budrika fino a 1000 m sul livello del mare nella zona di confine con la Macedonia (Stanqiq) . Gjilan / Gnjilane è ricco di minerale (ferro e leucide) e risorse minerali (Nasale, Pidico, Kmetoc, Uglare, Perlepnicë). Nelle mappe sismiche, Gnjilane è conosciuta come una regione ad alto rischio. Nel 2002, è stato colpito da un terremoto che ha lasciato un morto, decine di feriti e oltre 8.000 strutture danneggiate pubbliche e private. Gjilan è gemellato con le città ei comuni Luterbah (Francia), Iper (Belgio), Jelderim (Turchia) e altri